В 1505 р. на Краківському передмісті при збігу вулиць Казиміровської, Городоцької та Янівської було закладено первісний костел Св. Анни, що через 4 років згорів. В майбутньому він багаторазово був відбудований. Нинішня споруда походить з середини XVIII ст. Після скасування ордена в 1783 р. монастир використовували як школу, а костел став парафіальним. Свій теперішній вигляд він отримав у 1927 р., коли при реставрації ті відновленні храму за проектом архітектора Б. Віктора інакше завершення отримали вежі. В радянський час костел не використовувався за призначенням: якийсь час там були розташовані каси попереднього продажу халізничних квитків, а від 1960-х років у приміщенні костелу був розташований комісійний меблевий магазин.